Sejarah
Sebelum menjadi Rumah Sakit, Pimpinan Cabang Muhammadiyah Kutowinangun mendirikan Rumah Bersalin bernama “RB Siti Khotijah” Kutowinangun yang berdiri pada tanggal 30 Desember 1972 atas dasar inisiatif Bapak H.M. Yusuf Soebagiyono. Beliau salah satu dari Pengurus PCM Kutowinagun. RB Siti Khotijah bertempat di kediaman Bapak Haji Damiri di Jalan Pemuda N0.17 Kutowinangun sampai pada tahun 1986.
Kemudian sesuai dengan perkembangan yang telah ada di masyarakat Kutowinangun dan sekitarnya, maka pada tahun 1997 Rumah Bersalin Siti Khotijah ini berubah menjadi BP/RB PKU Muhammadiyah Kutowinangun dengan jumlah tempat dur 12 kamar dan bertempat di Jalan Pemuda No.12 Kutowinangun, Kebumen. Pada tahun 2004 BP/RB PKU Muhammadiyah Kutowinangun berubah menjadi Klinik PKU Muhammadiyah Kutowinangun.
Selanjutnya karena animo masyarakat Kutowinangun dan sekitarnya semakin meningkat, maka Pimpinan Cabang Muhammadiyah Kutowinangun memutuskan untuk meningkatkan pelayanan kesehatan dengan menaikan status BP/RB PKU Muhammadiyah menjadi Rumah Sakit Umum (RSU) PKU Muhammadiyah Kutowinangun dengan surat izin operasional sementara nomor : 503/1306/Dinkes/SISPRS/VIII/2004.
Pada Tanggal 27 Januari 2016 Badan Penanaman Modal dan Perizinan Terpadu Pemerintah Kabupaten Kebumen Mengesahkan RSU PKU Muhammadiyah Kutowinangun menjadi Rumah Sakit Umum tipe D dengan surat izin Operasional nomor: 503/01.02/KEP/I/2016.